[ntalaec]

Conseguí aclarar de dónde salió el disquete de la actualización 4.0 a 4.5:

Un coleccionista que tenía los 4 disquetes originales del juego y este disquete y que no tenía las actualizaciones, me dijo que este disquete se lo envió gratuitamente Dinamic Multimedia cuando llamó al teléfono de soporte técnico comentando que tenía problemas con el juego.
Es decir, este disquete no se incluyó en las actualizaciones que se podían comprar ni se enviaba sí o sí a usuarios registrados, sino que sólo se enviaba a aquellos usuarios registrados que llamaban para decir que tenían problemas con el juego.

Seguramente este disquete de actualización del PC Fútbol 2000 que apareció hace tiempo a la venta, también fue el mismo caso que el del 4.5:

Muy probablemente ese disquete incluye la actualización 1.6 de PC Fútbol 2000 descomprimida (ocupa unos 1.4 megas descomprimida, la capacidad del disquete).
¿Quizás hubo más actualizaciones como estas?

De todas formas, faltaría confirmar de dónde salió el disquete de la actualización 4.3:

Lo suelen tener los coleccionistas que compraron las actualizaciones del 4.0, pero ese "Actualización gratuita" es extraño.